При изучении глубинного строения геосистем, характеризующихся разноплановым строением верхних и нижних структурных этажей получение надежных представлений о геоэлектрическом строении не возможно без привлечения трехмерного математического моделирования МТ полей. В настоящем сообщении на примере Северного Кавказа и Тянь-Шаня показано, как результаты 3D модельных расчетов существенно корректируют геоэлектрические одномерные и двумерные разрезы. При этом используется технология изучения инвариантных характеристик тензора импеданса, что позволяет выделить те которые наиболее или наименее чувствительны к глубинным неоднородностям и менее искажены влиянием приповерхностных структур. В результате использования данной методики получены новые сведения о глубинном строении складчатых систем Северного Кавказа и Тянь-Шаня, их геодинамике в настоящем и прошлом.